警方最开始以为威廉只是一名入室抢劫犯，但警方在搜查过威廉的卧室之后很快改变了他们的看法。他们在那里发现了4件与前三起谋杀案以及这起盗窃案有关的证物，这些证物的出现让威廉马上陷入了舆论漩涡（当时美国并不注重保护嫌疑人的隐私）。在美国各界以及媒体的舆论压力下，警方甚至使用了暴力讯问的方法审讯嫌疑人。最终，警方通过将威廉的指纹与案发现场发现的指纹进行对比，证明了威廉就是制造三起凶杀案的凶手。威廉为了在庭审中争取不被判处死刑，他在律师的建议下在认罪书上签上了自己的名字。
1946年9月，威廉·海伦斯被判有罪，他被处以3个终身监禁，但故事到这里并没有结束。威廉在入狱后就开始翻供，他声称自己当时之所以认罪，不过是迫于死刑的压力。他还声称警方对自己注射的硫喷妥钠（吐真剂）影响了自己的思维意识，所以这种判决结果是不合法的。威廉的上诉持续了许多年，随着时间的流逝，有些证据也被一些权威人士所质疑。有些笔迹专家称威廉的笔迹和敲诈信的笔迹并不吻合，所以不能作为指控威廉的证据。有些律师则指出警方提供的指纹的形状很像是在警察局内使用墨水印台按的指纹，这就意味着当时警方有制造伪证的嫌疑。这些争议的出现使得FBI决定派遣心理专家前去调查威廉·海伦斯。